Ein geheimnisvoller Ring aus Metall und einige Steinplatten mit mysteriösen Zeichen sorgen im Ägypten des Jahres 1928 für Aufregung. Erst 65 Jahre später gelingt es dem Ägyptologen Dr. Daniel Jackson, das Rätsel zu entschlüsseln. Als er gemeinsam mit einer Gruppe von Soldaten unter der Führung von Colonel JO'Neill einen Weg durch das Tor findet, wird die Gruppe in eine ferne Galaxie verschlagen. Dort haust unter der Herrschaft eines blutrünstigen Tyrannen jenes Urvolk, das einst die Pyramiden erbaut hatte.

Die Armeen der Ori planen den finalen Angriff auf die Erde. Die letzte Hoffnung, die Feinde doch noch zu besiegen, liegt in der Ark of Truth, einem mächtigen Antikerartefakt. Daniel ist überzeugt, dass sich die Ark of Truth in der Heimatgalaxie der Ori befindet. Das SG-1-Team geht an Bord der "Odyssey" und bricht in die weit entfernte Galaxie auf. Während das Team auf zwei gefährliche Gegner trifft, verfolgt das IOA (International Oversight Advisory) auf der Erde einen eigenen Plan...

Jahre nach seiner spektakulären Mission durch das Sternentor wird Colonel Jonathan O'Neill von der amerikanischen Regierung um Hilfe gebeten, denn Außerirdische konnten das deaktivierte Sternentor durchdringen und eine Soldatin kidnappen. O'Neill sieht nur eine Möglichkeit. Er muß erneut durch das "Stargate" gehen. Auf der anderen Seite trifft er seinen alten Kollegen Dr. Jackson wieder, der auf dem fernen Planeten zurückgeblieben war. Auch hier hat man mit aggressiven, ungebetenen Besuchern zu kämpfen, denn der tyrannische Halbgott Ra konnte O'Neills Angriff überleben.

NSG-1 soll der Hinrichtung von Ba'al, dem letzten Systemlord, beiwohnen. Während das Team auf die Exekution wartet, verschwinden Teal'c und Vala plötzlich ins Nichts. Als Mitchell, Carter und Daniel zur Erde zurückkehren, erwartet sie eine böse Überraschung: Etwas Unerklärliches hat den Zeitverlauf verändert und somit auch die Gegenwart - das Stargateprogramm hat nie existiert! Unmittelbar darauf schwenken etliche Mutterschiffe der Goa'uld in die Erdumlaufbahn ein. Angeführt wird die mächtige Flotte von Ba'al, seiner Königin Qetesh (Vala) und Primus Teal'c mit dem Ziel, die Menschen zu versklaven. Es gibt nur eine Chance, die Erde zu retten: eine Korrektur des Zeitverlaufs. Doch dafür muss das verbliebene SG-1-Team das Stargate finden - und die Zeit wird knapp...